雨花开发区是宁沪高速、宁马高速、京沪高速铁路、皖赣铁路等8条省级交通线路重要节点。开发区内有4条道路与城区相连接——滨江大道（从下关区到三汊河直通马鞍山）、中兴大道（连接江东南路）、绕城公路、205国道。
开发区距南京火车站24公里，车程30分钟；距新生圩码头35公里，车程35分钟；距机场高速入口10公里，车程10分钟；距宁沪高速入口20公里，车程20分钟。